Az ökotoxikológia tudományterületének megfelelően a már ismert és az új szennyezőanyagok, ill. azok környezetre és élőlényekre gyakorolt ökológiai hatásainak megismerése. Annak bemutatása, hogy a környezetbe került idegen anyagok miként módosítják adott ökoszisztéma struktúráját és funkcióját, milyen mértékű kockázatot jelentenek az élő szervezetek számára.